1997 beginnt Peter Neubäcker mit der Entwicklung der Melodyne-Idee, im Oktober 2000 gründet er gemeinsam mit seiner Frau Prof. Dr. Hildegard Sourgens und dem Softwareentwickler und technischen Direktor Carsten Gehle die Firma Celemony Software GmbH mit Sitz in München. Melodyne wird 2001 auf der Winter-NAMM erstmals vorgestellt und erhält seitdem wegen seiner fantastischen Klangqualität und Innovationskraft zahlreiche internationale Preise.
Heute arbeiten fast 20 Mitarbeiter bei Celemony, es gibt mehrere Zehntausend registrierte Melodyne-User, der Vertrieb erfolgt weitweit über lokale Distributoren und über das Internet.
Auf der Musikmesse 2008 wurde die revolutionäre Technologie Direct Note Access vorgestellt, die es erstmals erlaubt, einzelne Noten in polyphonem Audiomaterial zu editieren. Das erste Produkt, das über DNA verfügt, wird die Version 2 des Melodyne plugin sein, die für den Herbst dieses Jahres angekündigt ist.